Tanto Kakashi como Danzou habían obtenido físicamente su Sharingan mediante un trasplante.
Durante el final de la Cuarta Guerra Mundial Shinobi, Madara arranca el Sharingan de Kakashi y lo trasplanta como su ojo izquierdo Capítulo 674 ).
Naruto, usando el poder de Hagaromo, crea un ojo normal para Kakashi Capítulo 675 ).
Del artículo de Naruto Wikia sobre Kakashi Hatake , resumen de la trama fusionada de los capítulos 686, 687 y 688 (el énfasis es mío):
Preparado para dar su vida para prestar la poca ayuda que pueda, Kakashi se pone delante de Sasuke para recibir el ataque mientras Obito hace lo mismo con Naruto. Aunque están unidos en su voluntad de morir, Obito decide que es demasiado pronto para Kakashi y utiliza a Kamui en el ataque destinado a él, dejando a Obito sin poder salvarse. El cuerpo de Obito se disuelve, pero su espíritu regresa poco después y habita en Kakashi. Obito siente que Kakashi se convertirá en el próximo Hokage y desea recompensarlo: un momento temporal de tener dos Mangekyō Sharingan.
Obito le dio a Kakashi el privilegio de tener ambos Sharingan (Mangekyou) temporalmente. Esto fue obra del espíritu de Obito y no del ser físico. Por lo tanto, el Sharingan que Kakashi utilizó estaba influenciado por el espíritu.
Más tarde, cuando Kaguya es derrotada, el espíritu de Obito deja el lado de Kakashi para unirse al otro mundo. Debido a que el espíritu se va, el Sharingan también desaparece junto con él.
Si el Sharingan hubiera estado físicamente presente, se habría quedado, al igual que Danzou, el cuervo Kotoamatsukami y Kakashi de antes de la guerra.
