La última página de Bleach #668 da algunas pistas.
Yachiru aparece de repente de la nada y le dice a Kenpachi:
Tontito, si me usaras bien, no habría nadie a quien no pudieras cortar.
Ella entonces lo toca, lo que causa:
que él reciba un aumento de poder, lo que le hace preguntarse.
Ella termina el intercambio explicándole:
Ese poder es lo que todo el mundo ha estado llamando “Bankai”.
Todos estos sugieren lo siguiente:
Yachiru es el Bankai de Kenpachi. Ya no puede llamar a su Bankai (nunca pudo, conscientemente - la aparición original puede haber ocurrido subconscientemente), por lo tanto, Yachiru se ha ido.
Alternativamente:
Yachiru es su espíritu Zanpaktou, otra vez, uno con el que nunca ha podido comunicarse conscientemente. Aunque, no puedo explicar su desaparición si ese fuera el caso.