Buena pregunta.
En la página de la wiki de Attack on Titan sobre los cambiantes de titán se dice que:
Según Rod Reiss, el poder de un metamorfo descansa en su médula espinal, lo que significa que para obtener los poderes de Titán, no es necesario comerse al metamorfo entero, más bien basta con morder la columna vertebral e ingerir su líquido cefalorraquídeo. El análisis de un suero recuperado de Rod Reiss también ha revelado que los sueros de los titanes, que en realidad es líquido cefalorraquídeo de los titanes, parecen contener ingredientes basados en el líquido cefalorraquídeo humano. Sin embargo, es difícil de estudiar, porque una vez que el líquido entra en contacto con el aire, se evapora al igual que los cadáveres de los Titanes.
Se puede ver durante el 5º episodio del anime
que cuando Eren es mordido por primera vez, su columna vertebral no está dañada.
Poco después, salva a Armin, entonces el Titán le arranca el brazo de un mordisco y luego se lo traga sin masticarlo. Esto significa que se metió en el estómago del Titán sin ningún daño en su columna vertebral, evitando que le quitaran sus poderes. Luego se transforma y se libera, no siendo necesario que continúe con la historia de cómo escapa y se vuelve loco.
Además, cuando Armin se come a Bertolt ocurre lo siguiente:
Se puede ver que Bertolt es mordido de forma que su columna vertebral se abrirá para que sus poderes pasen a Armin.
Resumiendo:
- Eren sobrevive durante la Batalla del Trost porque mantiene sus poderes y se transforma lo suficientemente rápido como para no ser cristalizado y regurgitado por el Titán.
- Conserva sus poderes porque su columna vertebral no fue dañada.
- Armin obtuvo sus poderes al comerse la columna vertebral de Bertolt, como se mostró anteriormente.
- En base a la información anterior, estos eventos no fueron un descuido del autor.