Hay un gran número de diferencias entre los dos anime de Fullmetal Alchemist, con demasiadas para enumerarlas; por lo tanto, sólo cubriré las principales.
Para mejorar el flujo de esta respuesta, se usarán las siguientes abreviaturas:
FMAM = Fullmetal Alchemist (Manga)
FMA03 = Fullmetal Alchemist 2003 (Anime)
FMAB = Fullmetal Alchemist Brotherhood (Anime)
La razón de la diferencia es porque FMA03 fue creado cuando FMAM estaba todavía en las primeras etapas de su desarrollo. Cuando una serie de anime se basa en un manga que aún está en desarrollo, el anime va a llegar a un punto en el que supera al manga, porque los episodios de anime tienden a desarrollarse más rápido que los volúmenes de manga. Cuando esto sucede, se crea un relleno para el anime o se hacen cambios en la historia y los personajes del anime para que éste pueda seguir desarrollándose. Esto último es lo que pasó con FMA03. La historia de FMA03 comenzó a divergir de la historia de FMAM después de unos 10 episodios porque, en ese momento, el anime comenzaba a superar al manga.
Por otro lado, FMAB fue creado cuando FMAM se acercaba al final de su desarrollo. Esto permitió que la historia del FMAB fuera más fiel a la historia del FMAM porque el FMAB tenía una historia mayormente completa para dibujar desde el FMAM.
Las principales diferencias entre FMA03 y FMAB & FMAM son:
Storyline
Aunque ambas historias siguen a Edward y Alphonse, la historia general es considerablemente diferente entre FMA03 y FMAB & FMAM. En FMAB & FMAM el principal antagonista era un personaje llamado Padre , un ser de increíble poder que es capaz de realizar la transmutación a voluntad, y sin tener en cuenta el intercambio equivalente. Su objetivo final en FMAB & FMAM es robar el poder de lo que él se refiere como “Dios” y convertirse en un ser de infinito poder y conocimiento.
El principal antagonista en FMA03 es Dante. A diferencia de Padre, es sólo un ser humano normal que creó una Piedra Filosofal y ha logrado vivir mucho tiempo transfiriendo su conciencia al cuerpo de otros seres humanos cuando estaba cerca de la muerte. La única motivación de Dante es convertirse en inmortal y vivir para siempre.
The Homunculus
En FMA03, los Homunculus fueron el resultado de intentar realizar la transmutación humana y fallar. Sólo podían ser asesinados destruyendo su cuerpo original.
En FMAB & FMAM, los Homúnculos fueron creados por el Padre, con cada uno representando un aspecto diferente de su personalidad ( Lujuria , Gluttonía , Envidia , Gredo , Ira , Vergüenza , Soledad , y Orgullo ; los siete pecados capitales). Cada homúnculo también es impulsado por una piedra filosofal. A diferencia de los homúnculos de FMA03, los homúnculos de FMAB y FMAM no tienen un cuerpo “original” que necesite ser destruido. En su lugar, o bien la Piedra Filosofal que los alimenta necesita ser destruida o su poder drenado (normalmente forzándolos a regenerarse varias veces).
Otra diferencia es la identificación de los propios Homúnculos, con algunos Homúnculos de FMAB & FMAM que no aparecen en FMA03 y otros que han cambiado de nombre.
Gluttony , Envy , Lust , y Greed tienen el mismo nombre y apariencia en FMAB, FMAM, y FMA03.
El Wrath de FMAB & FMAM (King Bradley) se llama Orgullo en FMA03.
El Pride de FMAB & FMAM (Selim Bradley) no está presente en FMA03.
El Wrath de FMA03 es único en la serie. Fue el resultado del intento de Izumi Curtis de revivir a su hijo.
FMAB & FMAM’s Sloth no está presente en FMA03.
FMA03’s Sloth es único en la serie. Ella fue el resultado del intento de Ed y Al de traer de vuelta a su madre.
Hohenheim
En FMA03, Hohenheim es sólo un ser humano normal que fue originalmente la amante de Dante; sin embargo, finalmente la dejó debido a que ya no compartía su deseo de tener la inmortalidad a cualquier costo. Como Dante, creó una Piedra Filosofal y ganó una larga vida transfiriendo su conciencia al cuerpo de otra persona. Su papel en el anime es muy menor, y queda atrapado al otro lado de la Puerta después de un enfrentamiento con Dante que terminó en fracaso.
En FMAB & FMAM, Hohenheim era una Piedra Filosofal humana con un suministro de poder aparentemente infinito. Aunque originalmente era un esclavo, su padre le concedió su casi inmortalidad mucho antes de que los eventos de la serie tuvieran lugar. Hohenheim es más significativo en FMAB & FMAM, enfrentándose a Padre al final de la serie. A diferencia del Hohenheim de FMA03, muere al final de FMAB & FMAM después de haber agotado finalmente el poder de su Piedra Filosofal.
La Puerta
La Puerta es el mayor cambio importante de la serie. En FMAB & FMAM, la Puerta es la fuente de toda la alquimia y también parece ser una fuente de conocimiento infinito. La Puerta también está custodiada por un ser comúnmente conocido como Verdad , y que es responsable de cobrar los peajes necesarios a los alquimistas que realizan la transmutación humana. Aquellos que son capaces de realizar la alquimia tienen su propia puerta, y si esa puerta es removida (sacrificándola a la Verdad), ya no podrán realizar la alquimia.
En FMA03, la Puerta sigue siendo la fuente de la alquimia, pero también sirve como un portal entre el mundo del Alquimista Completo y la Tierra. Además, la Puerta deriva sus poderes de las almas de aquellos que han muerto en la Tierra y es lo que potencia las transmutaciones realizadas por los alquimistas.