Update
Comenzamos a ver el significado detrás de la D. En el episodio 703 del Anime…
…Corazón habla con Trafalgar D. Law, diciéndole cómo los niños pequeños en Marie Jois son instruidos para ver a D. como una especie de cuco:
“Los niños que se comportan mal serán comidos por la D.”
Él continúa diciendo que en algunas partes del mundo, la Familia de D. es conocida como 神の天敵 (kami no ten teki), traducida como “el enemigo natural de Dios”.
También afirma que “Dios” en este caso se utiliza para referirse a los Dragones Celestiales.
Creo que aún no se ha revelado.
La inicial fue señalada por primera vez en la esquina de preguntas y respuestas de Oda SBS , también se le preguntó qué significaba la D en el nombre de Luffy. Oda sólo respondió que lo leería como una D por ahora y que revelaría la verdad detrás de ella con el tiempo.
Puedes leer más en la wiki Voluntad de la D. .